それぞれのキャンパスにさまざまな部や同好会があり、全国高専大会での優勝などを目指し、活発な部活動をしています。1年〜3年生は高校総体・高校野球・高校駅伝・春高バレーなどにも参加し、インターハイや国体に出場する選手もいます。
熊本キャンパス
- 【体育系】
ハンドボール部／ソフトテニス部／弓道部／ラグビー部／バドミントン部／テニス部／水泳部／サッカー部／剣道部／卓球部／バレー部／バスケットボール部／野球部／陸上部 ほか体育系同好会 - 【文化系／技術系】
吹奏楽部／軽音楽部／電子計算機部／イラスト研究部／放送部／ロボコン部／茶道部／ESS部 ほか文化系同好会
八代キャンパス
- 【体育系】
水泳部／陸上部／弓道部／剣道部／柔道部／少林寺拳法部／野球部／ラグビー部／サッカー部／フットサル部／ハンドボール部／テニス部／ソフトテニス部／バスケットボール部／バレーボール部／バドミントン部／卓球部 - 【文化系】
茶道部／吹奏楽部／音楽研究部／英語研究部／写真同好会／NITKボランティアサークル同好会 - 【技術系】
ロボコン部／ラジコン研究部／情報システム研究部／the plastic arts 同好会
それぞれのキャンパスに以下のような施設があり、充実した練習を行えます。
野球場、第1グラウンド、第2グラウンド、第1体育館、第2体育館、柔道場、剣道場、弓道場、プール、ロボコンハウス、音楽練習室、クラブハウス、文化系サークル室、和室 など
